由于高效過濾器一般作為過濾末端，因此對高效過濾器的各項要求也為嚴格，出廠需逐臺檢測。高效過濾器作為末端是各級過濾器中關鍵的一級，需要額外的“觀照”。要延長高效過濾器的使用壽命，根本的辦法是將灰塵擋在預過濾器。更換預過濾一般無須停產、無須調試，所以有經驗的業主會把注意力和金錢放在預過濾器上。對于10000級和100000級潔凈廠房。預過濾可選用F8過濾器（比色法95%），這樣，末端高效過濾器的使用壽命一般可達五年。在國外項目中和國內新項目中，F8過濾器是非均勻流潔凈室常見的預過濾器。對于芯片廠100級，10級或更高級別的潔凈廠房，預過濾器的常見效率級別為H10（MPPS85%），許多新項目索性選用HEPA（對0.3um粒子的效率≥99.97%）。在國內過去的潔凈室空調系統設計中，過濾器常見配置為：粗效→中效→高效。那時高效過濾器的使用壽命僅為1—3年，差的也就幾個月。可見，預過濾器的效率高低決定末端過濾器使用的壽命。
有些場合，對高效過濾使用壽命的規定不是出于對阻力的考慮，而是其它因素。若廠房中有氫氟酸，而車間空調又不全新風系統，高效過濾器的玻璃纖維濾紙會受到回風的腐蝕，為了安全，必須定期更換高效過濾器。有些財大氣粗的制藥廠，每年雨季過后要更換高效過濾器，為的是防止過濾器上任和可能的霉菌污染。有些生物實驗室和與危險品打交道的實驗室，在開展一項新的重要課題前，為了可靠，應使用新的高效過濾器。
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